Η Δρ. Πρωτόπαπα Σοφία είναι Κλινική Σύμβουλος Ψυχικής Υγείας, με πιστοποιήσεις για τη θεραπεία του ψυχολογικού τραύματος από το Trauma Research Foundation, την TACT Hellas και την Evergreen Certifications. Είναι πιστοποιημένη Κλινική Επόπτρια (Certified Supervision Professional) και Σύμβουλος Σταδιοδρομίας (Global Career Development Facilitator) από το National Board of Certified Counselors των Η.Π.Α. Είναι μέλος της Ελληνικής και της Ευρωπαϊκής Εταιρείας Συμβουλευτικής. Υλοποιεί ομάδες για τη διαχείριση του κοινωνικού άγχους και του συνδρόμου του καλού παιδιού, την καλλιέργεια της υγιούς αυτοεκτίμησης, την ανάπτυξη της διεκδικητικής συμπεριφοράς και τη διαχείριση της τελειομανίας. Εστιάζει στην ενδυνάμωση του ατόμου ώστε να μπορέσει να διαχειρίζεται αποτελεσματικά τα θέματα που αποτελούν πρόκληση στη ζωή του, όπως άγχος, κατάθλιψη ή τον φόβο της απόρριψης. Είναι επόπτρια μεταπτυχιακών φοιτητών ψυχολογίας και συμβουλευτικής κατά τη διάρκεια της
πρακτικής τους άσκησης.
Από το 2014, στον ρόλο της ως Σύμβουλος Σταδιοδρομίας, αναλαμβάνει τη συμβουλευτική
εφήβων σε θέματα όπως επιλογή σπουδών και επαγγέλματος, άγχος και κρίσεις πανικού σε σχέση με τις πανελλαδικές εξετάσεις.
Από το 2003, είναι καθηγήτρια εφαρμοσμένης ψυχολογίας σε προπτυχιακά και μεταπτυχιακά
προγράμματα σπουδών και δίνει ομιλίες και διαλέξεις σε ακαδημαϊκά ιδρύματα και εταιρείες σε
αντικείμενα που άπτονται της εμπειρίας και της έρευνάς της.
Μέχρι τώρα, έχει γράψει τρία βιβλία μόνη ή με συνεργάτες της:
Ηγεσία για Παιδιά: Ένας οδηγός για γονείς, εκπαιδευτικούς και προπονητές για την ανάπτυξη των
ηγετικών χαρακτηριστικών και ικανοτήτων των παιδιών, 2019, Εκδόσεις Ψυχογιός
Eudaimonia as a way of life: A conversation with Aristotle inspired by the Nicomachean Ethics, 2016, Αυτοέκδοση
Συναισθηματική Ευημερία-Συναισθηματική Χρεωκοπία: Η μία, η άλλη όψη, 2015, Εκδόσεις Πληθώρα