Η Πεπονή Ελένη είναι Περιοδοντολόγος - Εμφυτευματολόγος και διατηρεί ιδιωτικό ιατρείο στο Νέο Ηράκλειο. Κατέχει μεταπτυχιακό δίπλωμα τριετούς ειδίκευσης στην Περιοδοντολογία, το οποίο ολοκλήρωσε στο Εθνικό και Καποδιστριακό Πανεπιστήμιο Αθηνών, ύστερα από την απόκτηση του πτυχίου της από την Οδοντιατρική Σχολή του ίδιου Πανεπιστημίου. Εξειδικεύτηκε στην Περιοδοντολογία και στην Εμφυτευματολογία, τις οποίες ασκεί αποκλειστικά σήμερα στο ιδιωτικό της ιατρείο. Παράλληλα με το ιατρείο της, είναι Επιστημονική συνεργάτης Περιοδοντολογίας στην Οδοντιατρική Σχολή του Εθνικού και Καποδιστριακού Πανεπιστημίου Αθηνών. Έχει εκπονήσει ερευνητικές εργασίες στο αντικείμενο της Περιοδοντολογίας, έχει συμμετάσχει ως ομιλήτρια σε επιστημονικά συνέδρια και έχει δημοσιεύσει επιστημονικά άρθρα σε ελληνικά και διεθνή περιοδικά. Τέλος, η γιατρός είναι μέλος της Ελληνικής Περιοδοντολογικής Εταιρείας και της European Federation of Periodontology.